近日，福建省第二人民医院联合1331银河在线游戏首页共同发表了一篇临床案例，此案例应用 Q-mNGS Onco 排除感染，同时利用宿主基因组拷贝数变异提示肿瘤， 研究成果发表在《BMC pulmonary medicine》(IF = 3.317)。 福建省第二人民医院呼吸与危重症医学科魏萍为第一作者， 王春娥主任和1331银河在线游戏首页刘超博士为通讯作者， 1331银河在线游戏首页王肖嘉和李彩云共同参与此研究。

背景介绍：

肺脓肿和肺癌的影像学征象有许多相似之处，因此诊断时难以准确区分。肺脓肿是一种感染性疾病，其特征是存在脓腔，而高达 22% 的原发性肺癌会显示出相似的空洞。在胸部 CT 中观察到空洞性病变时，临床医生通常会先考虑肺脓肿的可能性，因为它更常见。关于肺部疾病的初步诊断通常是经验性的，取决于传统的微生物检测、CT 扫描以及炎症和肿瘤的血清学生物标志物。然而，由于炎症和肿瘤都能使肿瘤标志物等临床指标升高，并且考虑到炎症伴随肿瘤同时存在的情况，这些测试可能会模糊甚至导致错误的诊断。当多种疾病共同出现某些症状时，初步诊断可能不准确，从而延误有效治疗。因此，在经验性治疗失败的情况下，像 mNGS 这样全面、无偏见的检测可对诊断提供非常有效的帮助。

病例描述：

患者林某，女性，62 岁。主诉 “咳嗽、咳痰、咯血 1 月余，发热 3 周”。患者 1 月前无明显诱因出现咳嗽、咳痰，痰少色黄无恶臭，夹血丝，无呼吸困难等，就诊当地市医院，胸部 CT“右下肺脓肿”，血常规：WBC 19.83x10⁹/L，GR 85%,CRP 108.3mg/L，PCT 0.056ng/ml，予哌拉西林、左氧氟沙星抗感染，3 周前出现发热，最高体温 40°C，热峰未退。后转诊福州两家三甲医院呼吸科、肿瘤科门诊，均考虑 “肺脓肿”，先后予莫西沙星、头孢噻肟抗感染，热峰未退。患者既往有 “高血压病”6 月，血压控制良好。无过敏史。无吸烟史。

患者感染指标普遍升高，肿瘤标志物（SCC,CYFRA21_1,CEA）指标较高，全腹 CT 显示肝内胆管小结石，肝囊肿，余未见明显异常。胸部 CT 现实右肺下叶高密度肿块，病灶内多发空洞，可见气液平面，空洞周围边界模糊，可见不规则磨玻璃样阴影。右肺下叶包裹积液、积气，考虑脓肿。培养见念珠菌属+（痰）和曲霉菌 1cfu（肺泡灌洗液）。初步诊断为肺脓肿。

影像学检测结果：

胸部 CT，彩超，气管镜。右肺下叶混合回声团块-考虑病灶内部含气体液化坏死区。主气管通畅，未见分泌物，左、右主支气管及各叶段支气管腔内未见新生物、异物、出血，右下叶背段支气管腔内可见少量白粘痰。

Q-mNGS 检测-基因组拷贝数分析结果：

从上到下依次为患者标本，阴性对照和阳性对照标本。

基因组拷贝数分析显示患者存在明显的拷贝数变异。

组织活检结果：

患者右肺下叶穿刺活检标本染色。同一行左右两图为相同部位不同放大倍数的染色图像。结合免疫组化，考虑为肺鳞癌。

治疗经过及预后:

Table 1. 临床诊断与治疗时间表

WBC: 白细胞; GR: 粒细胞; CRP: C 反应蛋白; PCT: 血小板计数; CEA， SCC，CYFRA21_1: 肿瘤指标

术后第二天（7 月 31 日）患者不再发热，抗生素降级为头孢哌酮钠舒巴坦，8 月 13 日出院。9 月 8 日回医院复查，肿瘤指标正常。

案例总结：

• mNGS 有助于临床医师快速诊断病原体未知的感染性疾病，尤其是在经验性抗感染失败时，建议早期行 mNGS 检测以指导下一步靶向抗感染治疗。

近日，湖南省儿童医院联合1331银河在线游戏首页共同开展了关于新生儿感染研究，并应用 Q-mNGS 针对传统病原学阴性的新生儿感染患者进行病原检测和监控治疗，研究成果发表在《Frontiers in Microbiology》（IF 5.64）。湖南省儿童医院新生儿科张榕副教授为本文第一作者，1331银河在线游戏首页刘超博士和湖南省儿童医院彭小明主任为通讯作者。

01 研究背景

感染性疾病是导致新生儿死亡的重要原因。2019 年全球报告每 100 名活产婴儿中有 17 人死亡，每天有 6,700 名新生儿死亡，约 48% 的 7 天以上新生儿死亡可归因于微生物感染。本研究汇报了 10 例传统方法未能阐明病因的严重感染新生儿患者，对这些患者进行定量宏基因组测序（Q-mNGS，实现人源和病原的相对定量），成功发现病原体并根据 Q-mNGS 结果辅助监控疗效。

02 主要研究结果

10 名参与者的年龄从 2 天到 52 天不等，其中 4 名参与者 (40%) 是女性。疾病类型包括肺炎、败血症和脑膜炎，入组患者的临床特征列于表 1。研究对 10 名患儿同时进行传统微生物检测（培养、抗原检测和 PCR）和 Q-mNGS 检测，结果显示，传统病原学检测均为阴性，而 Q-mNGS 则检测到结核分枝杆菌、嗜肺军团菌、蜡样芽孢杆菌等病原体。后续临床根据 Q-mNGS 检测结果进行抗生素调整及疗效监控，有 8 名患儿在治疗后恢复健康，10 名患者 Q-mNGS 检测结果见表 2。

表 1 入组患者的临床特征

表 2 10 名患者的 mNGS 检测结果

本研究中，当所有常规方法都未能发现新生儿感染的 “罪魁祸首” 时，Q-mNGS 提供了准确的病原学诊断依据，并指导针对性使用抗生素治疗。因此有望降低新生儿感染的疾病管理总体成本和患者负担。

案例一：结核分枝杆菌

19 日龄男性患儿 1 出现发烧和呼吸急促及呼吸衰竭。外周血、痰、脑脊液的结核分枝杆菌培养为阴性，炎症指标 CRP 为 153.04 mg/dL，降钙素原 (PCT) 为 16.44 ng/ml，入院 2 天后外周血 Q-mNGS 检出结核分枝杆菌（序列数 59 条，相对丰度 83.1％，病原指数（Q 指数）10723.30，排位 86.03%），TAT 仅为 13 小时。随后血液 T.SPOT 试验和痰标本 Xpert MTB/RIF 试验阳性，患儿及母亲也呈现出结核感染影像学特征，基于此临床诊断该患儿为先天性结核病，并进行针对性治疗后患儿恢复正常。 

图 1 患儿的胸部 CT 结果

图 2 结核分支杆菌感染的诊疗过程

案例二 ：嗜肺军团菌

4 日龄的女性患儿 2 出现发烧和咳嗽，并迅速恶化。炎症指标 CRP 高于 320 mg/dL，PCT 为 1.07ng/mL，乳酸水平为 4.3mmol/L。痰、血液、脑脊液和 BALF 微生物培养均为阴性，入院 12 天后肺泡灌洗液和外周血进行 Q-mNGS 检出嗜肺军团菌（BALF 序列数为 24055 条，相对丰度 96.18%，Q 指数 22014.71，排位 91.05% 和外周血序列数 361 条，相对丰度 96.52%，Q 指数 13653.88，排位 71.54%）。肺泡灌洗液进行 16s 核糖体 RNA (rRNA) 测序及血嗜肺军团菌 IgM 抗体检测结果阳性。基于此临床诊断该患儿为军团菌肺炎，针对性采用红霉素治疗，并送检外周血标本进行 Q-mNGS 连续检测，监控嗜肺军团菌的载量，治疗 33 天后未检出嗜肺军团菌，停止用药并进行随访，患儿生长和神经发育均正常。

图 3 Q-mNGS 和 16s 核糖体 RNA(rRNA) 测序检出嗜肺军团菌

图 4 嗜肺军团菌感染的诊疗过程

案例三：蜡样芽孢杆菌

15 日龄女性患儿 10，出现呼吸急促 15 天、发热 3 天、抽搐 2 天。炎症指标 CRP 为 168.1mg/dL，PCT 为 18.12ng/mL。脑脊液检查显示白细胞 9.65×109/L，葡萄糖 1.02mmol/L，蛋白质 2.64g/L。痰、血液、脑脊液微生物培养均为阴性，脑脊液生化提示细菌性脑炎，送检脑脊液进行 Q-mNGS 检测，检出蜡样芽孢杆菌序列数 61 条，相对丰度 6.21%，Q 指数 9559.24，排位 94.4%。结合患儿的脑部影像学特征及 16rRNA 测序结果，临床拟诊蜡样芽孢杆菌感染。送检脑脊液标本进行 Q-mNGS 连续检测，监控蜡样芽孢杆菌的载量，调整抗生素方案。3 个月随访患儿感染指标恢复正常，仍存在弥漫性脑软化症。

图 5 蜡样芽孢杆菌感染的诊疗过程

2022 新年伊始，1331银河在线游戏首页（以下简称 “1331银河在线游戏首页”）与国内领先的分子诊断技术企业苏州思纳福医疗科技有限公司（以下简称 “思纳福医疗”）正式签订战略合作协议，双方将发挥感染病原分子检测和数字 PCR 技术领域的优势，通过深入的科研合作，探索创新分子诊断技术在感染病原检测领域的创新应用。

感染性疾病一直是当今世界严重威胁人类健康和生命的重大疾病。目前，全球感染性疾病的发病率不断上升，病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势。及时、准确的医疗诊断是有效防治感染性疾病的重要手段。传统病原微生物检测技术存在不同局限，而分子生物学技术检测凭借高灵敏度、准确性强、报告时间短等特点，逐渐成为病原微生物检测的主流方法学。当前，感染性疾病的精准诊疗依旧面临不少的挑战，病原体的早期确定和准确鉴别对感染性疾病的预防及有效控制有非常重要的意义。

为了解决常见病原体的诊断难题，1331银河在线游戏首页携手思纳福医疗通过紧密的技术科研合作，努力探索挖掘分子诊断技术在感染性疾病领域的创新应用。作为感染性疾病新一代分子诊断技术的创新推动者，1331银河在线游戏首页致力于将数据驱动与产品创新相结合，开拓先进的分子诊断技术在感染性疾病等人类健康领域的应用。2020 年，公司首推 Q-mNGS 定量宏基因组检测，将 mNGS 推进到 “定量” 时代；随着技术的持续升级迭代，2021 年1331银河在线游戏首页推出了 Q-mNGS 自动化解决方案，实现了 13 小时内完成 mNGS 检测全流程。

目前已与中国医学科学院北京协和医院、复旦大学附属华山医院、广州呼吸健康研究院等国内顶级临床机构建立了深入合作，共同开展临床应用与医学转化研究。

思纳福医疗旨在通过技术革新，为行业提供快速、灵敏、精准、智能的分子诊断解决方案。2020 年，公司推出全球首款无需微流控芯片的一体化数字 PCR 检测设备 DQ24。凭借操作便捷、结果准确、灵敏度高，成本可控等优势，2021 年客户已达 100 多家，其中包括中国医学科学院北京协和医院、中国人民解放军总医院、国家计量院等权威机构，并拿到 FDA、CE、NMPA 的临床准入许可。

目前已有多款试剂进入注册阶段，有望实现数字 PCR 技术在各应用场景的落地和普及。

随着本次战略合作的顺利达成，1331银河在线游戏首页与思纳福医疗将在新的一年里开拓创新，并肩前行，共同拓展分子诊断新技术在病原感染病原检测领域的应用。通过更快速、更精准的分子诊断技术帮助临床提高常见感染病原的检出率，让每位感染患者第一时间得到精准诊疗。

关于思纳福医疗

思纳福医疗专注于新一代分子诊断技术的研发和产业化，凭借其独创的 “振动注射” 技术，推出了全球首款无需微流控芯片的一体化数字 PCR 检测设备，彻底解决了数字 PCR 技术在临床应用中存在的成本过高，操作复杂的核心痛点。经过多年积淀，思纳福医疗逐步形成了以 “技术革新为前提，先进工艺为核心，全产业链整合为基础，精细化管理为保障” 的四位一体发展策略。公司立足中国，面向世界，旨在通过不断的技术革新，为行业提供快速、灵敏、精准、智能的分子诊断解决方案。

关于1331银河在线游戏首页

1331银河在线游戏首页是一家专注于感染性疾病分子诊断的高新技术企业。秉承创新驱动发展的经营理念，致力于将数据驱动与产品创新相结合，开拓先进的分子诊断技术在感染性疾病等人类健康领域的应用，让疾病诊断更简单、更快速、更智能。公司聚焦感染疾病精准医疗领域，布局多项核心专利技术，已形成基因编辑（CRISPR/Cas）和高通量测序（NGS）两大前沿技术平台，搭建起了多层次，高品质的产品线及服务体系，为临床患者提供感染性疾病分子诊断的整体解决方案。

近日，国家药品监督管理局官网发布 YY/T 1836-2021（呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒）的行业标准，并于 2022 年 12 月 1 日开始实施的公告（2021 年第 144 号）。新的标准规定了呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒（以下简称试剂盒）的要求、试验方法、标签和使用说明书、包装、运输和贮存。本次 YY/T 1836-2021（呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒）标准由国家食品药品监督管理总局提出。 由全国医用临床检验实验室和体外诊断系统标准化技术委员会 (SAC/TC 136) 归口。
1331银河在线游戏首页作为标准起草单位之一，参与了本次行业标准的制定。

呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒行业标准，将多重呼吸道病毒核酸检测领域推向高潮，也意味着自 2019 年 11 月 17 日国家药监局公布呼吸道病毒多重核酸检测试剂注册技术审查指导原则后又一重磅性标准的确立，也为以后 IVD 企业呼吸道多重核酸检测试剂注册指明了方向。标准适用于呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒的质量控制，试剂盒适用的样本类型包括但不限于：鼻咽拭子、鼻拭子、咽拭子、肺泡灌洗液、痰液或其他呼吸道分泌物；适用的待检测的呼吸道病毒包括但不限于：

甲型流感病毒（Influenza A，IFV A）

乙型流感病毒（Influenza B，IFV B）

呼吸道合胞病毒（Respiratory Syncytial Virus，RSV）

副流感病毒（Parainfluenza Virus，PIV）

人偏肺病毒（Human Metapneumovirus，hMPV）

腺病毒（Adenovirus，Adv）

呼吸道感染肠道病毒（肠道病毒/鼻病毒）（Enterovirus，EV/ Rhinovirus， RhV）

冠状病毒（Coronavirus，CoV）

适用的检测方法包括但不限于：

荧光 PCR 法

液相/固相芯片法

PCR 熔解曲线法

等温扩增法

CR 毛细电泳片段分析法

第二代测序技术等

呼吸道多重核酸检测试剂盒行业标准正文

1. 范围本标准规定了呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒（以下简称 “试剂盒”）的要求、试验方法、标签和使用说明书、包装、运输和贮存。

本行标适用于呼吸道病毒多重核酸检测试剂盒的质量控制，试剂盒适用的样本类型包括但不限于：鼻咽拭子、鼻拭子、咽拭子、肺泡灌洗液、痰液或其他呼吸道分泌物；

适用的待检测的呼吸道病毒包括但不限于：甲型流感病毒（Influenza A，IFV A）、乙型流感病毒（Influenza B，IFV B）、呼吸道合胞病毒（Respiratory Syncytial Virus，RSV）、副流感病毒 (Parainfluenza Virus，PIV)、人偏肺病毒（Human Metapneumovirus，hMPV）、腺病毒（Adenovirus，Adv）、呼吸道感染肠道病毒（肠道病毒/鼻病毒）（Enterovirus，EV/ Rhinovirus， RhV）、冠状病毒（Coronavirus，CoV）；

适用的检测方法包括但不限于：荧光 PCR 法、液相/固相芯片法、PCR 熔解曲线法、等温扩增法、PCR 毛细电泳片段分析法及第二代测序技术等。

2. 规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。GB/T 191 包装储运图示标志 GB/T 29791.1 体外诊断医疗器械 制造商提供的信息（标示） 第 1 部分：术语、定义和通用要求 GB/T 29791.2 体外诊断医疗器械 制造商提供的信息（标示） 第 2 部分：专业用体外诊断试剂

3. 要求

3.1 外观外观应符合如下要求：

a) 试剂盒各组分应齐全、完整，液体无渗漏；

b) 中文包装标签应清晰，无磨损；

c）生产企业规定的其他外观要求。

3.2 核酸提取功能核酸提取功能应符合如下要求：

a）包含核酸提取组份的试剂盒，生产企业应对核酸提取做适当要求，并对核酸提取功能进行验证。

b）样本需要提取，但不含有核酸提取组份的试剂盒，由生产企业说明或指定提取试剂盒，并提供验证或确认资料。

c）样本无需提取，直接进行扩增的试剂盒，生产企业应能提供充分证据，以证明其抗干扰性。

3.3 阳性参考品符合率用试剂盒检测范围内的国家参考品或经标化的企业阳性参考品进行检测，结果应均为相应病毒阳性，并与预期型别一致（如适用）。经标化的企业阳性参考品应符合以下要求：

a）阳性参考品应覆盖试剂盒声称可检出的主要呼吸道病毒型别和亚型。企业参考品应包括不少于试剂盒检测范围内国家参考品的病毒型别和亚型；

b）阳性参考品应尽量覆盖弱阳、中阳及强阳性等不同浓度水平，弱阳性应使用 1.5~4 倍检出限浓度；

c）可根据试剂盒特点将不同病原体混合后作为阳性参考品使用。

3.4 阴性参考品符合率用国家参考品或经标化的企业阴性参考品进行检测，不在试剂盒检测范围内的病原体应均为阴性。经标化的企业阴性参考品应符合以下要求：

a）阴性参考品应纳入不在试剂盒检测范围内、易引发相似症状、或感染部位相同的其他病原体样本。企业参考品应包括不少于国家参考品的病原体类型；

b）建议在病毒和细菌感染的医学相关水平进行验证，通常，细菌感染的水平为 1X106CFU（菌落形成单位）/mL 或更高，病毒为 1X105PFU（空斑形成单位）/mL 或更高；

c）可根据试剂盒特点将不同病原体混合后作为阴性参考品使用。

3.5 检出限用国家检出限参考品或经标化的企业检出限参考品进行检测，结果应符合国家参考品或企业声称的相应要求。经标化的企业检出限参考品应符合以下要求：

a）检出限参考品应包含试剂盒可检出的呼吸道病毒主要型别及亚型；

b）病毒浓度单位可采用 TCID50（半数组织细胞感染量）、PFU 或 copies/mL；

c）应根据试剂盒特点，必要时设置混合检出限参考品，对临床上常见的呼吸道病毒混合感染情况下（如甲型流感病毒与呼吸道合胞病毒）高浓度分析物对低浓度分析物检测的影响进行评估。

建议使用同一反应体系内病毒、常见重症感染病毒及常见混合感染病毒，将一种最低检测限浓度的分析物和一种高浓度分析物混合作为检出限参考品。

3.6 精密度用国家参考品或经企业标化的精密度参考品进行检测，结果应符合国家参考品或企业声称的相应要 3 求。经标化的企业精密度参考品应符合以下要求：

a）可不包含所有涉及的呼吸道病毒型别和亚型，但应选择多个临床较常见的型别；

b）应至少设置弱阳性、中阳或强阳性两个水平，弱阳应使用 1.5~4 倍检出限浓度；

c）可将不同病原体混合后作为精密度参考品使用。

3.7 稳定性（讨论是否保留）可对效期稳定性和热稳定性进行验证：

a) 效期稳定性：企业应规定试剂盒的有效期。取到效期后一定时间内的试剂盒，检测外观、阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、检出限和精密度，结果应符合 3.1、3.3-3.6 项相应要求；

b) 热稳定性：在企业规定的加热条件下处理试剂盒，检测外观、阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、检出限和精密度，结果应符合 3.1、3.3-3.6 项相应要求。

注 1：一般地，效期为 1 年时选择到效期后不超过 1 个月的产品，效期为半年时选择到效期后不超过半个月的产品，以此类推。但如超过规定时间，产品符合要求时也可接受；

注 2：热稳定性不能用于推导产品有效期，除非是采用基于大量的稳定性研究数据建立的推导公式；

注 3：根据产品特性可选择 a)、b) 方法的任意一种或两种，但所选用方法宜能验证产品的稳定性，以保证在效期内产品性能符合标准要求。

4 . 试验方法

4.1 外观在自然光下以正常视力或矫正视力目视检查，结果应符合 3.1 的要求。

4.2 核酸提取效率功能适用时，按照生产企业提供的方法进行试验，检测结果应符合 3.2 的要求。

4.3 阳性参考品符合率用国家参考品或经标化的企业阳性参考品进行检测，按产品说明书进行操作，结果应符合 3.3 的要求。

4.4 阴性参考品符合率用国家参考品或经标化的企业阴性参考品进行检测，按产品说明书进行操作，结果应符合 3.4 的要求。

4.5 检出限用国家参考品或经标化的企业检出限参考品进行检测，按产品说明书进行操作，结果应符合 3.5 的 4 要求。

4.6 精密度

4.7 稳定性可选用以下一种或两种方法进行验证：a) 效期稳定性：取到效期后一定时间内的试剂盒，按产品说明书进行操作，结果应符合 3.7a) 的要求。b) 热稳定性：将试剂盒在一定温度条件下放置一定时间，按产品说明书进行操作，结果应符合 3.7 b) 的规定。

5. 标签和说明书应符合 GB/T 29791.2 的规定。

6 . 包装、运输、贮存 6.1 包装包装储运图示标志应符合 GB/T 191 的规定。包装容器应保证密封性良好，完整，无泄露，无破损。6.2 运输试剂盒应按生产企业的要求运输。在运输过程中，应防潮，防止重物堆压，避免阳光直射和雨雪浸淋，防止与酸碱物质接触，防止内外包装破损。6.3 贮存试剂盒应在生产企业规定条件下保存。